Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EXOSC2Q13868 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms