Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3B2Q13367 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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