Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MRPL28Q13084 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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