Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDE4DQ08499 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms