Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RPS29P62273 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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