Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CABP4P57796 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CABP4P57796 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CABP4P57796 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABP4P57796 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABP4P57796 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABP4P57796 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CABP4P57796 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABP4P57796 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABP4P57796 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABP4P57796 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABP4P57796 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABP4P57796 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABP4P57796 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABP4P57796 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CABP4P57796 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CABP4P57796 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CABP4P57796 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CABP4P57796 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms