Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASP9P55211 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP9P55211 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP9P55211 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP9P55211 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CASP9P55211 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASP9P55211 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CASP9P55211 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms