Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPAP49450 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPAP49450 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms