Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA2P47869 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA2P47869 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms