Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TGFBR1P36897 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms