Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CTNNB1P35222 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTNNB1P35222 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms