Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HOXA10P31260 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms