Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XPAP23025 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XPAP23025 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
XPAP23025 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XPAP23025 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XPAP23025 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XPAP23025 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
XPAP23025 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XPAP23025 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
XPAP23025 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
XPAP23025 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms