Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBP07199 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBP07199 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBP07199 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBP07199 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBP07199 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBP07199 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBP07199 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBP07199 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBP07199 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBP07199 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBP07199 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBP07199 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBP07199 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBP07199 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBP07199 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBP07199 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPBP07199 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPBP07199 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPBP07199 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBP07199 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms