Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNBD2Q96M20 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNBD2Q96M20 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms