Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LRIG3Q6UXM1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LRIG3Q6UXM1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms