Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ANKRD54Q6NXT1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ANKRD54Q6NXT1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms