Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIP4Q15650 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIP4Q15650 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms