Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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NR1H3Q13133 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NR1H3Q13133 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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