Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPN12Q05209 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms