Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID5AQ03989 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID5AQ03989 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms