Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3AP98173 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms