Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ITGB3P05106 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms