Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCER2I3L3R5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCER2I3L3R5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms