Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEURL1BA8MQ27 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms