Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F8A0AVK6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms