Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP36Q9P275 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USP36Q9P275 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms