Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U6

MRPL18, 39S ribosomal protein L18, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL18Q9H0U6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
MRPL18Q9H0U6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms