Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5RAP3Q96JB5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5RAP3Q96JB5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms