Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SFT2D1Q8WV19 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SFT2D1Q8WV19 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SFT2D1Q8WV19 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SFT2D1Q8WV19 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SFT2D1Q8WV19 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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SFT2D1Q8WV19 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SFT2D1Q8WV19 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SFT2D1Q8WV19 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SFT2D1Q8WV19 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SFT2D1Q8WV19 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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