Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBP6

SLC25A40, Solute carrier family 25 member 40, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A40Q8TBP6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A40Q8TBP6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms