Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC62Q6P9F0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC62Q6P9F0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms