Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCSAPQ6IQ19 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCSAPQ6IQ19 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms