Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPARCL1Q14515 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPARCL1Q14515 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPARCL1Q14515 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPARCL1Q14515 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPARCL1Q14515 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPARCL1Q14515 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPARCL1Q14515 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms