Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 NTRK1-210ENST00000534682 844 ntTSL 413.14□□□□□ -0.313e-7■■□□□ 14.1
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TARDBPQ13148 FADS3-213ENST00000534426 558 ntTSL 412.02□□□□□ -0.491e-6■■□□□ 14.1
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TARDBPQ13148 TBL1XR1-228ENST00000636864 6888 ntTSL 52.1□□□□□ -2.071e-6■■□□□ 14.1
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TARDBPQ13148 EIF3D-204ENST00000426531 710 ntTSL 29.72□□□□□ -0.853e-6■■□□□ 14.1
TARDBPQ13148 EIF3D-208ENST00000458572 883 ntTSL 38.3□□□□□ -1.083e-6■■□□□ 14.1
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TARDBPQ13148 PKM-205ENST00000561609 1568 ntTSL 1 (best)10.42□□□□□ -0.745e-9■■□□□ 13.9
TARDBPQ13148 PKM-207ENST00000562997 582 ntTSL 410.26□□□□□ -0.775e-9■■□□□ 13.9
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TARDBPQ13148 PKM-210ENST00000564178 554 ntTSL 48.96□□□□□ -0.985e-9■■□□□ 13.9
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TARDBPQ13148 ETF1-201ENST00000360541 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.683e-7■■□□□ 13.9
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TARDBPQ13148 ETF1-205ENST00000506345 933 ntTSL 1 (best)6.49□□□□□ -1.373e-7■■□□□ 13.9
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TARDBPQ13148 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.076e-11■■□□□ 13.9
TARDBPQ13148 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.111e-7■■□□□ 13.9
TARDBPQ13148 CNTNAP2-219ENST00000637150 1767 ntTSL 512.36□□□□□ -0.431e-7■■□□□ 13.9
TARDBPQ13148 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.611e-7■■□□□ 13.9
TARDBPQ13148 TMEM91-201ENST00000342187 454 ntTSL 510.77□□□□□ -0.696e-11■■□□□ 13.9
TARDBPQ13148 TBC1D15-215ENST00000548679 657 ntTSL 310.5□□□□□ -0.731e-7■■□□□ 13.9
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