Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms