Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B2Q01814 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B2Q01814 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms