Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
COPAP53621 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
COPAP53621 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
COPAP53621 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
COPAP53621 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms