Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKX2-5P52952 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms