Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PDE6DO43924 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6DO43924 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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