Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC9Q9UKV0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HDAC9Q9UKV0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms