Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK3Q9UBP4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms