Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SH3BP4Q9P0V3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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