Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW66

CINP, Cyclin-dependent kinase 2-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CINPQ9BW66 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CINPQ9BW66 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms