Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSAMQ8N6F7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms