Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APTXQ7Z2E3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APTXQ7Z2E3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms