Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FGD6Q6ZV73 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms