Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q6Q795 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q6Q795 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q6Q795 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q6Q795 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q6Q795 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q6Q795 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q6Q795 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q6Q795 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms