Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATXN8Q156A1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms