Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM53BQ14153 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM53BQ14153 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms